מכון המחקר NGO Monitor ניתח את הדו״ח הכספי של הקרן החדשה לישראל לשנת 2016, המפרט את מענקי הקרן למגוון רחב של ארגונים לא-ממשלתיים בישראל. הניתוח מתמקד ב-20% מהמענקים שאושרו ל-29 ארגונים המזוהים עם פעילות לקידום זכויות אדם.
מחזור המימון של מנהלת זכויות האדם והמשפט הבינלאומי לפרויקטים בחודשים ספטמבר 2015 עד אוגוסט 2016 מתמקד בירושלים, בטענה כי "הלחצים הגוברים על האוכלוסייה הפלסטינית במזרח ירושלים הכבושה במהלך החודשים האחרונים, גרמה לכך שמנהלת זכויות האדם והמשפט הבינלאומי ראתה צורך להדגיש ביתר שאת את מזרח ירושלים..."
ניתוח מעמיק של שישה מסמכים שמקורם במשרדי נציגויות האיחוד האירופי בישראל וברשות הפלסטינית. מסמכים אלו עוסקים במדיניות ממשלת ישראל בתחומים מורכבים ורגישים ביותר: ירושלים; "שטח C"; מעמדם של אזרחים ערבים-ישראלים; והאשמות לגבי אלימות מצד מתנחלים. המסמכים חוזרים על האשמות כוזבות שהועלו בדוחות של ארגונים פוליטיים לא-ממשלתיים אשר מקבלים את החלק הארי של מימונם מהאיחוד האירופי וממדינות אירופיות.